इसके बाद 10 मई से इस मामले की जांच का जिम्मा ईओयू को सौंप दिया गया। 22 जून को मामला सीबीआई को ट्रांसफर कर दिया गया। इससे पहले तक पूरे मामले की तफ्तीश के साथ ही तमाम गिरफ्तारी ईओयू के स्तर से की गई थी। इसकी चरणवार जानकारी रिपोर्ट में दी गई है। सूत्रों के अनुसार रिपोर्ट में खासतौर से यह जानकारी दी गई है कि नीट का पेपर लीक हुआ है। 

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प्रश्न-पत्र लीक होने से संबंधित तमाम साक्ष्य भी रिपोर्ट में हैं। पटना के खेमनीचक स्थित निजी स्कूल से बरामद जले हुए प्रश्न-पत्र का कोड अंकित हिस्सा के अलावा एडमिट कार्ड, दस्तावेज समेत अन्य कई साक्ष्य हैं। इसी स्थान से 13 लोगों की गिरफ्तारी हुई थी। इसमें प्रश्न-पत्र का उत्तर रटने वाले 4 अभ्यर्थी भी हैं। इनकी निशानदेही पर पटना में कई स्थानों पर हुई छापेमारी में बरामद रकम लिखे चेक, पासबुक, बैंक लेनदेन से जुड़े कागजात समेत अन्य सभी महत्वपूर्ण दस्तावेज रिपोर्ट के साथ संलग्न हैं।